the first living systems : a bioenergetic perspective

Los primeros sistemas de Moléculas con las propiedades del estado de vida, Presumiblemente auto-ensambladas con una mezcla de compuestos orgánicos disponibles en la Tierra prebiótica. PARA LLEVAR A CABO LA Característica de la síntesis de polímeros, los sistemas REQUIEREN una o más fuentes de energía para activar los Monómeros al Ser incorporados en los polímeros. Posibles fuentes de energía para este proceso incluyen : el calor, la energía de luz, la energía química, y los potenciales iónicos un través de membranas. Estas fuentes de energía se exploran aquí, con un enfoque particular sobre los Mecanismos por los cuales auto-ensambladas agregados moleculares Podrían capturar la energía y la Utilizan para Formar enlaces químicos en los polímeros. Basados en la evidencia disponible, una conjetura Razonable es que las vesículas membranosas Estaban presentes en la Tierra prebiótica y que los Sistemas de Replicación de MACROMOLÉCULAS y Podría Convertirse en catalizador encapsulado en las vesículas. En el laboratorio, esto puede ser modelado por las polimerasas encapsuladas en los Liposomas. Una Adecuada Selección de los lípidos, las propiedades de permeabilidad de los Liposomas Pueden ajustarse de forma que los sustratos iónicos permeado A UN ritmo Suficiente para Proporcionar una fuente de Monómeros de las enzimas, con el resultado de que los ácidos nucleicos se acumulan en las vesículas . A Pesar De Estos Progresos, todavía no existe un Mecanismo claro Mediante el Cual la energía libre de la Luz, Gradientes iónicos, o potencial redox Puede ser acoplada a la formación de polímeros es una estructura protocellular

SYSTEMS BIOLOGY: A BRIEF OVERVIEW

El articulo se trata acerca de comprender la biología a nivel de sistema, debemos examinar la estructura y la dinámica de la función celular y organísmica, en lugar de las características aisladas de una célula o organismo.
Un sistema biológico puede entenderse a traves de cuatro propiedades fundamentales:

1) las estructuras del sistema. Estos incluyen la red de interacciones entre los genes y vías bioquímicas, así como los mecanismos por los que estas interacciones modular las propiedades físicas de intracelular y las estructuras multicelulares.

2) La dinámica de sistemas. ¿Cómo se comporta un sistema en el tiempo bajo diversas condiciones ? puede ser a través del análisis del metabolismo, el análisis de sensibilidad, los métodos de análisis dinámico como el retrato de fase y el análisis de bifurcación, y mediante la identificación de los mecanismos esenciales de subyacentes comportamientos específicos.

3) El método de control. Los mecanismos que controlan el estado de la célula pueden ser modulados para minimizar el mal funcionamiento y ofrecer posibles terapéuticas para el tratamiento de la enfermedad.

4) El método de diseño. Las estrategias para modificar y construir sistemas biológicos con propiedades deseadas pueden concebirse basada en los principios de diseño definitivo y las simulaciones, en vez de ciego de ensayo y error.

SYSTEMS BIOLOGY : THE ELEMENTS AND PRICIPLE OF LIFE

La Biología de sistemas tiene una misión que la pone en contradicción con los paradigmas tradicionales de la física y la biología molecular, tales como la sencillez solicitada por el principio de Occam y la energía de eficacia mínima / máxima Biología de sistemas no converge bien con la biología bastante aunque ciertamente requiere de esa ciencia, descubriendo propios principios fundamentales
Aunque la biología de sistemas ha tenido una prehistoria larga y diversa , no se ha aceptado absolutamente con todo como la nueva manera de la cual la biología se debe hacer, o como la manera de la cual la física debe dar vuelta a las ciencias de la vida. Una razón puede ser que ha divergido la biología de sistemas substancialmente ambos de sus orígenes en bioquímica y biología molecular y de sus orígenes en la física y la biología matemática

La física simple: principios generales, leyes generales, maquinilla de afeitar de Occams y energía mínim
la física descompone la realidad que estudia en piezas mucho más pequeñas que consistan en muy pocos, componentes bien definidos.
la búsqueda para los principios fundamentales, el descubrimiento de cuantitativo las leyes, el paradigma de la simplicidad atribuyeron a Occam, y al paradigma de la energía mínima

2.3. Principios de biología de sistemas La biología se refiere a veces como poder del `de los gusanos. Esto se refiere a la diversidad enorme de la biología, con sus millones de diferente especie. La declaración también sugiere la ausencia de principios generales de biología, cada organismo que se comporta diferentemente. El origen de tales ideas pueden residir en la biología pre-Lamarckian, donde toda la especie eran de hecho probablemente diferente, en origen y por lo tanto en naturaleza. Pero con Lamarck y Darwin, la evidencia fue recogida y las hipótesis entró en la existencia que afirmó el cLa física está acostumbrada para reducir sus sistemas de estudio a dos o tres componentesontrario, es decir esa especie tenía un origen común y era por lo tanto algo similar .

2.4. Leyes de la biología de sistemas Pero por otra parte, las leyes de la física son generalmente más cuantitativas
La biología de sistemas se ha roto con este alojamiento de la biología de ser cuantitativa y ha revelado leyes de la biología


2.5 Occams para la biología de sistemas se usa en :
2.5.1. Los genomas que son más complejos a los que son simples La física está acostumbrada para reducir sus sistemas de estudio a dos o tres componentes